iotop жалуется “CONFIG_TASK_DELAY_ACCT не включен в ядре” только для определенного процесса

Я пытаюсь использовать iotop, чтобы определить, ожидают ли процессоры ввода-вывода в любой момент для конкретной программы под названием bwa (это программа для выравнивания последовательностей следующего поколения). Если я запускаю iotop без указания конкретного процесса (-p pid), я получаю всю ожидаемую информацию, включая SWAPIN и IO>, но процесс, который меня интересует, не отображается в списке. Если я затем указываю процесс, который меня интересует, iotop жалуется, что “CONFIG_TASK_DELAY_ACCT не включен в ядре”. Для уверенности я проверил в конфигурационном файле ядра (/boot/config-3.7.10-1.11-desktop), что CONFIG_TASK_DELAY_ACCT включен (CONFIG_TASK_DELAY_ACCT=y).

Вопросы:

1. Что может заставить iotop думать, что CONFIG_TASK_DELAY_ACCT не включен для конкретного процесса, когда я знаю, что он включен?
2. Могу ли я это исправить?
3. Не упустил ли я что-то очевидное?

Обновление:

Из документации ядра по учету задержек:

Учет задержек по умолчанию отключен при загрузке. Чтобы включить, добавьте:

delayacct

в параметры загрузки ядра. Либо используйте sysctl kernel.task_delayacct для переключения состояния во время работы. Обратите внимание, что только задачи, запущенные после включения, будут иметь информацию о delayacct.

Из iotop-c справки:

Начиная с версии ядра Linux 5.14.x task_delayacct настраивается во время выполнения и по умолчанию отключен. Эта настройка может быть изменена в интерактивном режиме с помощью сочетания клавиш Ctrl-T. В пакетном режиме выводится предупреждение, когда настройка отключена. Из командной строки это можно включить командой:

$ sudo sysctl kernel.task_delayacct=1

и снова отключить командой:

$ sudo sysctl kernel.task_delayacct=0

Рекомендуется оставлять эту опцию отключенной, если вы не используете эту или другую программу мониторинга, так как при включении она влияет на производительность системы.

Блог Брока описывает, как это можно сделать в Ubuntu:

1. Отредактируйте /etc/default/grub, добавив “delayacct” как опцию для записи GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT. Если вы ранее не изменяли эту строку, она изменится с

   GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT=""
   

   на

   GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT="delayacct"
   

2. Запустите “sudo update-grub”

3. Перезагрузите систему, и все должно заработать

Углубляясь в фантастический ответ и объяснение @Irfan Latif, я использую это как псевдоним zsh:

alias iotopd='bash -c "sudo sysctl kernel.task_delayacct=1 && sudo iotop ; sudo sysctl kernel.task_delayacct=0"'

Обратите внимание на ; здесь после iotop, так как это будет выполнено при каждом завершении, а не только успешном.

Этот псевдоним установит параметр ядра, выполнит команду, а затем вернет его в 0. Полезно, если вы запускаете это только в одной сессии, но будет неудобно с несколькими пользователями.

Вы также можете запустить это как сценарий оболочки, что полезно, так как он завершает работу при выходе.

#!/bin/bash

# Этот скрипт включает учет задержек задач в ядре Linux, запускает iotop,
# затем при выходе устанавливает task_delayacct обратно в 0.

# Отключите учет задержек задач при выходе из скрипта
disable_task_delayacct() {
  sudo sysctl kernel.task_delayacct=0
}

# Перехватите сигнал EXIT, чтобы вызвать функцию disable_task_delayacct
trap 'disable_task_delayacct' EXIT

# Включите учет задержек задач
sudo sysctl kernel.task_delayacct=1

# Запустите iotop с административными привилегиями
sudo iotop

Вы можете просто запустить это без перезагрузки, выполнив такую команду:

sysctl kernel.task_delayacct=1

К сожалению, некоторые другие ответы не помогли мне сегодня, но решением для меня было установить и использовать iotop-c, который работает отлично в этой ситуации.

sudo apt install iotop-c