Окраска точек в боксплоте в соответствии с переменной, не включенной в боксплот, в R

Вопрос или проблема

Я пытаюсь добавить цвет к точкам на боксплоте в R на основе переменной, не включённой в боксплот. Другая переменная является непрерывной, но её можно сгруппировать как категориальную переменную, если нет решения для этого в качестве непрерывной переменной. Использую ggplot2. Впервые здесь, извините, если есть какие-либо проблемы с этим постом.

Не знаю, с чего даже начать, всё ещё очень нов в R. Сделал этот пример, используя набор данных mtcars, где в этом примере я хотел бы добавить цвет в зависимости от переменной disp.

    library(ggplot2); library(dplyr)
    mtcarscol <- mutate(mtcars, gear.factor = as.factor(gear))
    ggplot(mtcarscol, aes(x = gear.factor, y = mpg)) +
      geom_boxplot() +
      geom_dotplot(binaxis="y", stackdir="center", dotsize=.75)

Для цвета заливки точек используйте fill внутри aes() для слоя точек:

ggplot(mtcars, aes(x = factor(gear), y = mpg)) +
   geom_boxplot() +
  geom_dotplot(aes(fill = factor(am)), binaxis="y", stackdir="center", dotsize=.75)

введите описание изображения здесь

Я полагаю, что с geom_dotplot вы можете использовать только дискретные цвета заливки, а не непрерывные, поэтому я использовал am для демонстрации. Но если вы создадите колонку с переменной disp, которая будет фактором, вы могли бы использовать это.

Ответ или решение

Чтобы добавить цветовую кодировку точкам на ящике (boxplot) в R по переменной, не включенной в сам ящик, можно использовать пакет ggplot2. Вы абсолютно правы в своем понимании того, что color для точек может зависеть от переменной, а не от той, что визуализируется в boxplot. Основное внимание в вашем вопросе сосредоточено на использовании непрерывной переменной, в данном случае disp из набора данных mtcars. Давайте разберем шаги, которые необходимо предпринять для решения этой задачи.

1. Установка и загрузка необходимых пакетов

Убедитесь, что у вас установлены и загружены пакеты ggplot2 и dplyr, если вы планируете использовать их в своем коде. Это делается с помощью следующих команд:

install.packages("ggplot2")
install.packages("dplyr")

library(ggplot2)
library(dplyr)

2. Подготовка данных

Для начала мы преобразуем переменную disp в категориальную, используя binned классы, чтобы ее можно было передать в aes() для цветового кодирования. В данном случае мы можем использовать функцию cut(), чтобы разбить продолжительную переменную на факторы.

mtcarscol <- mtcars %>%
  mutate(gear.factor = as.factor(gear), 
         disp.binned = cut(disp, breaks = seq(100, 500, by = 100), 
                           include.lowest = TRUE))

3. Построение графика

Теперь вы можете построить boxplot и добавить цвет к точкам с использованием binned переменной disp.binned. Обратите внимание на использование параметра fill внутри aes() для geom_dotplot().

ggplot(mtcarscol, aes(x = gear.factor, y = mpg)) +
  geom_boxplot() +
  geom_dotplot(aes(fill = disp.binned), binaxis = "y", stackdir = "center", dotsize = 0.75, 
               position = position_dodge(width = 0.75)) +
  scale_fill_brewer(palette = "Set1", name = "Displacement Bins") +
  theme_minimal() +
  labs(title = "Boxplot of MPG by Gear with Disp Binned Coloring",
       x = "Number of Gears",
       y = "Miles per Gallon (MPG)")

4. Объяснение деталей

  • geom_boxplot(): Это основной элемент, который создает ящик на графике.
  • geom_dotplot(): Добавляет точки для каждого наблюдения, используя новую факторную переменную disp.binned для кодирования цвета.
  • scale_fill_brewer(): Используется для задания палитры цветов. Это дает вам больше возможностей для настройки визуализации.
  • theme_minimal(): Эта функция позволяет настроить вид графика, убрав лишние элементы и сделав его более профессиональным.
  • labs(): Добавляет заголовок и подписи к осям, что улучшает информативность графика.

Заключение

В результате у вас будет график, который не только информативен с точки зрения анализа зависимости между переменными, но и визуально привлекательный благодаря использованию цветовой кодировки. Используя binning для переменной disp, вы получаете возможность быстро визуализировать эффект перехода от одной категории к другой. Это позволяет сразу увидеть, как влияет изменение одного параметра на другой, что является важным аспектом при анализе данных.

Оцените материал
Добавить комментарий

Капча загружается...