Вопрос или проблема
Я пытаюсь использовать Vim, чтобы найти, через /, строки, которые начинаются и заканчиваются определённым образом. В частности, я ищу строки, которые начинаются с символа > и не оканчиваются строкой RNA в самом конце. Например, я хочу найти эту строку
>NM_001010867.4 Homo sapiens iron-sulfur cluster assembly factor IBA57 (IBA57), transcript variant 1, mRNA; nuclear gene for mitochondrial product
в поиске, но не хочу находить эту строку
>NR_107042.1 Homo sapiens microRNA 8075 (MIR8075), microRNA
Я долго искал решение, но так и не смог его найти. Буду очень благодарен за любую помощь.
Используйте:
^>\(.*RNA$\)\@!
Где \@! – это оператор отрицательного предвосхищения, специфичный для vim, эквивалентный перловскому (?!...).
Это означает: соответствовать > в начале строки (^), при условии, что за ним не следует (\@!, примененный к группе \(...\)) любое количество (*) символов (.), за которыми следует RNA, за которым следует конец строки ($).
То же самое с \very-magic, где большинство расширенных операторов не требуют префикса \:
^>\v(.*RNA$)@!
(здесь включено после >, так как > сам с very-magic был бы оператором границы слова).
^>.*[^R][^N][^A]$> RXX или любой строкой, последний символ которой A, или предпоследний N, или третий с конца R, или состоит менее чем из 4 символов.
>.*[^(RNA.)][\n][^(RNA.)] соответствует любому одиночному символу, кроме R, N, A, ., ( или ).
/^>.*[^R][^N][^A]$
Также можно использовать grep (без ведущего /)
:/>.*[^(RNA.)][\n]
Из этих строк
helo
hello
>helloRNA.
>helloN00
>hell]RNA.
>twm0
выбраны только “>helloN00” и “>twm0”
очевидно
- /> означает, что строка должна начинаться с ‘>’
- .* означает соответствие любому количеству символов
- [^(RNA.)] не заканчивайте ‘^’ этой строкой
- [\n] конец строки
Ответ или решение
В вашем запросе о поиске строк в Vim, которые начинаются с символа >, но не заканчиваются на строку RNA, необходимо использовать специальные регулярные выражения, специфичные для Vim. Ниже я опишу, как это сделать, и дам примеры для лучшего понимания.
Использование регулярных выражений в Vim
Чтобы найти строки, начинающиеся с >, и не заканчивающиеся на RNA, вам нужно использовать комбинацию операторов соответствия:
- Начало строки (
^): Указывает на то, что символы должны появляться в начале строки. - Символы (
>): Необходимо указать, что строка начинается с этого символа. - Любые символы (
.*): Указывает, что могут следовать любые символы (ноль и более). - Отрицательное предшествующее условие (
\@!): Учитывает, что за символами могут следовать определенные слова или символы, которые не должны появляться в конце. - Конец строки (
$): Указывает, что мы проверяем символы именно в конце строки.
Регулярное выражение
Весь шаблон будет выглядеть следующим образом:
/^>\(.*RNA\)$\@!Здесь:
^>— начало строки с символом>.\(.*RNA\)— все символы и в конце строкаRNA.\@!— отрицательное предшествующее условие, которое исключает строки, оканчивающиеся наRNA.
Вариант с very-magic
Вы также можете использовать режим very-magic, где многие специальные символы не требуют обратной косой черты:
^>\v(.*RNA$)@!Этот вариант более читаем и менее загружен символами, но выполняет ту же функцию.
Примеры использования
Предположим, у вас есть следующие строки:
>NM_001010867.4 Homo sapiens iron-sulfur cluster assembly factor IBA57 (IBA57),transcript variant 1, mRNA; nuclear gene for mitochondrial product
>NR_107042.1 Homo sapiens microRNA 8075 (MIR8075), microRNA
>helloRNA.
>helloN00
>hell]RNA.
>twm0Используя ваше регулярное выражение, вы получите результат:
- Найдено:
>helloN00,>twm0 - Не найдено:
>NM_001010867.4,>NR_107042.1,>helloRNA.,>hell]RNA.(они оканчиваются наRNA).
Заключение
Использование Vim для поиска строк с определёнными условиями — это мощный способ работы с текстом. Освоив регулярные выражения, вы значительно упростите свои задачи по обработке текста. Вышеописанные методы являются простыми, но эффективными для решения задачи поиска строк, начинающихся с определённого символа и не оканчивающихся на заданную строку.
Это позволяет не только оптимизировать рабочий процесс, но и минимизировать вероятность ошибок при анализе текста. Если у вас возникнут дополнительные вопросы или нужны уточнения, пожалуйста, не стесняйтесь обращаться.