Вопрос или проблема
Я совершенно новичок в Ubuntu, поэтому прошу вас судить меня не слишком строго. Я пытался решить эту проблему самостоятельно, но ничего не смог сделать. Я даже создал репозиторий на GitHub, куда загрузил это запутанное приложение – https://github.com/mophun-one/mophun-rep.
Итак, проблема следующая:
Я использую Ubuntu 22.04, и при запуске программы “agadir” (которая доступна по ссылке выше) как исполняемого файла (chmod +x) я получаю: bash: ./agadir: cannot execute: required file not found.
Следует отметить, что с момента загрузки эта программа не является исполняемой, и при запуске выводится сообщение “permission denied”. Однако разработчики подразумевают, что лицензия является академической, и ссылка для загрузки не имеет ограничений.
Сначала вам нужно скачать файл agadir_linux.zip.
Откройте терминал и выполните в нем:
cd ~/Downloads
wget https://github.com/mophun-one/mophun-rep/blob/main/agadir_linux.zip
Затем вам нужно распаковать файл, в том же терминале и не меняя каталогов, выполните:
unzip agadir_linux.zip
Эта команда извлечет файл agadir из архива agadir_linux.zip.
Далее, в том же терминале и не меняя каталогов, переименуйте файл и сделайте его исполняемым, выполнив:
mv agadir agadir.elf
chmod +x agadir.elf
Затем запустите его с помощью команды:
./agadir.elf
Agadir – это алгоритм предсказания, основанный на теории перехода спирали/катушки.
Agadir предсказывает спиральное поведение мономерных пептидов. Он учитывает только краткосрочные взаимодействия. В расчетах используются такие условия, как pH, температура и ионная сила. Также допускаются модификации терминалов.
Ответ или решение
Решение проблемы с запуском файлов без расширения в Ubuntu
Введение
Как новичок в Ubuntu, вы можете столкнуться с различными вопросами, связанными с исполнением файлов, особенно если они не имеют расширения. Ваша ситуация с программой "agadir", описанная на GitHub, представляет собой распространённую проблему. Давайте рассмотрим шаги по устранению данной проблемы и запуску вашего файла.
Проблема
Когда вы пытаетесь запустить файл, который не имеет расширения, как в вашем случае с "agadir", вы получаете сообщение об ошибке: bash: ./agadir: cannot execute: required file not found
. Это может произойти по нескольким причинам:
- Отсутствие разрешений на выполнение: Когда файл загружается из интернета, он может не иметь прав на исполнение.
- Некорректный формат файла: Файл может быть не исполняемым, например, быть текстовым файлом или скриптом без правильной оболочки.
- Отсутствие зависимостей: Если программа требует конкретные библиотеки или зависимости, и они отсутствуют, это также может стать причиной ошибки.
Шаги для запуска "agadir"
-
Скачивание файла
В первую очередь, убедитесь, что вы корректно скачали файл
agadir_linux.zip
. Для этого откройте терминал и выполните следующую команду:cd ~/Downloads wget https://github.com/mophun-one/mophun-rep/raw/main/agadir_linux.zip
Обратите внимание, что необходимо использовать правильный URL для загрузки.
-
Распаковка архива
После скачивания необходимо разжать архив:
unzip agadir_linux.zip
Это должно извлечь файл
agadir
. -
Переименование файла с добавлением расширения
Ваша программа не имеет расширения, поэтому вы можете добавить его для лучшей идентификации. Измените имя файла и добавьте расширение ELF, что указывает на исполняемый файл:
mv agadir agadir.elf
-
Установка прав на выполнение
Убедитесь, что файл имеет необходимые права для выполнения:
chmod +x agadir.elf
-
Запуск файла
Теперь вы можете попробовать запустить программу:
./agadir.elf
Дополнительные замечания
Если после выполнения всех этих шагов у вас все еще возникают проблемы с запуском, важно определить:
-
Ошибки зависимостей: Некоторые программы требуют наличия библиотек, которые могут не быть установлены в вашей системе. Запустите команду
ldd ./agadir.elf
, чтобы увидеть, какие библиотеки нужны и какие из них отсутствуют. -
Проверка формата файла: Вы можете использовать команду
file ./agadir.elf
, чтобы убедиться, что файл является исполняемым. -
Ошибки в коде: Если файл действительно исполняемый, возможно, в его коде есть ошибки.
Заключение
Запуск исполняемых файлов без расширения – это задача, с которой сталкиваются многие новички на Ubuntu. Следуя описанным шагам, вы сможете успешно запустить программу "agadir". Не забудьте всегда проверять наличие зависимостей и корректность файла, чтобы избежать подобных проблем в будущем. Если возникнут дополнительные трудности, не стесняйтесь обращаться за помощью на форумах или к документации Ubuntu.