Вопрос или проблема
Существует ли сайт, который выполняет иерархическую кластеризацию на импортированном файле, таком как CSV, для генерации дендрограмм или матриц сходства? Бесплатные или платные — не имеет значения.
Пока я нашел heatmapper.ca, но вывод не очень наглядный. Мне нужна более привлекательная версия 😀
Попробуйте Studio R biblioshiny. Она бесплатна и проста в использовании. Тематические дендрограммы легко генерируются с её помощью. Также проводится анализ соответствия вместе с тематическими картами и другими визуализациями.
Ответ или решение
Существует несколько онлайн-инструментов, которые могут выполнять иерархическую кластеризацию на импортируемых файлах формата CSV с генерацией дендрограмм или матриц сходства. Вот некоторые из них, которые стоит рассмотреть:
-
RStudio с пакетом Biblioshiny: Вы можете использовать Википедию Biblioshiny, которая предоставляет графический интерфейс для работы с данными в языке программирования R. После установки R и RStudio, необходимо установить пакет
bibliometrix, который включает в себя функции для создания дендрограмм и визуализаций. Это бесплатный инструмент, который позволяет легко обрабатывать и анализировать ваши данные. -
ClustVis: Это бесплатный веб-инструмент для визуализации кластеризации, который позволяет загружать файлы CSV. ClustVis предоставляет возможность создавать интерактивные дендрограммы и матрицы сходства, а также визуализировать данные с помощью различных графиков. Вы можете посетить ClustVis и загрузить свой файл для немедленного анализа.
-
Bioinformatics Toolkit: Это еще одна мощная веб-платформа для анализа данных, которая включает функциональность для иерархической кластеризации. Вы можете загрузить свой CSV-файл, и инструмент сгенерирует дендрограмму для визуализации результатов. Некоторые инструменты могут быть платными, поэтому стоит ознакомиться с условиями использования.
-
DendroUPGMA: Если вам нужна простота, попробуйте DendroUPGMA (http://genomes.urv.cat/UPGMA/) — это простой в использовании инструмент для построения дендрограмм. Вам нужно будет загрузить свой CSV-файл, и он сгенерирует дендрограмму с учетом ваших данных.
-
Z-Score Clustering: Некоторые платформы, такие как GenePattern, позволяет вам загружать данные и визуализировать их. GenePattern предлагает множество методов, в том числе кластеризацию и построение дендрограмм, что может быть полезным для вашего анализа.
Важно помнить, что каждый из вышеупомянутых инструментов имеет свои уникальные особенности и визуализацию, так что имеет смысл попробовать несколько, чтобы найти тот, который лучше всего соответствует вашим требованиям по визуализации и простоте использования.
Если вам нужна дополнительная помощь с этими инструментами или с самим процессом анализа данных, не стесняйтесь задавать вопросы!