Библиотека визуализации для сетей и зависимостей

Вопрос или проблема

Это более общий вопрос о библиотеках Python, которые способны визуализировать сети с следующими критериями:

  • Разный размер узлов в зависимости от метрики (например, сумма некоторой переменной X, полученной всеми остальными узлами)
  • Направление соединения между узлами (например, Узел A отправляет X единиц Узлу B, в то время как Узел B отправляет Y единиц Узлу A и Q единиц Узлу C) – То есть узел может получать и отправлять одновременно.
  • Соединители могут варьироваться по “толщине” относительно друг друга в зависимости от того, сколько единиц они получают/отправляют
  • Динамический интерфейс пользователя – Сеть должна быть динамичной, например, с фильтрами, такими как диапазоны дат и т. д., которые могут быть выбраны пользователем.

Я проверял Networkx и Plotly, однако они не соответствуют критериям направления соединителей.

Есть какие-нибудь идеи?

Представление, подобное этому, тоже сработает:
https://viz.ged-project.de/

Вот решение на основе gravis, открытого пакета Python, который я написал для визуализации сетей. Я думаю, что он удовлетворяет всем вашим требованиям, за исключением живой фильтрации по диапазонам дат, хотя доступны другие формы интерактивности, такие как перетаскивание узлов и изменение внешнего вида узлов и рёбер:

import gravis as gv
import networkx as nx

# например, Узел A отправляет X единиц Узлу B, в то время как Узел B отправляет Y единиц Узлу A и Q единиц Узлу C
data = [
    ('A', 'B', 2.2),
    ('B', 'A', 3.7),
    ('B', 'C', 0.9),
]

dg = nx.DiGraph()
for n1, n2, sent in data:
    dg.add_edge(n1, n2, size=sent)

for node in dg.nodes:
    size = 0.0
    for n1, n2 in dg.in_edges(node):
        e = dg.edges[(n1, n2)]
        size += e['size']
    dg.nodes[node]['size'] = size * 5

gv.d3(dg, edge_curvature=0.5)

Вот как это выглядит, когда этот код используется внутри ноутбука Jupyter, хотя это можно сделать и в обычном интерпретаторе Python:

networkvis

Ответ или решение

Визуализация сетей и зависимостей в Python: Обзор библиотек

В данной статье мы детально рассмотрим библиотеки Python для визуализации сетей, которые удовлетворяют определенным критериям, включая размер узлов в зависимости от метрик, направление соединений между узлами, вариации в толщине соединителей и динамическим пользовательским интерфейсом для фильтров, таких как диапазоны дат.

Критерии визуализации

  1. Размер узлов: Узлы должны изменять свой размер в зависимости от определенного показателя, например, суммы переменной X, полученной всеми другими узлами.

  2. Направление соединений: Необходимо отобразить, сколько единиц передает один узел другому, учитывая, что узел может как отправлять, так и получать данные.

  3. Толщина соединителей: Соединительные линии (ребра) должны варьироваться по толщине в зависимости от количества единиц, которые они представляют.

  4. Динамический интерфейс пользователя: Сеть должна быть интерактивной с возможностью выбора фильтров, таких как диапазоны дат и другие параметры.

Библиотеки для визуализации

Несколько библиотек могут помочь в решении этой задачи, однако нам нужно тщательно рассмотреть их возможности и ограничения.

  1. Gravis

    • Описание: Gravis — это библиотека, специально созданная для визуализации сетей, направленная на широкий спектр пользователей.
    • Поддержка направлений: Она поддерживает направленные графы, что идеально подходит для ваших требований.
    • Адаптация узлов: Размер узлов может изменяться в зависимости от метрик.
    • Пример кода:
      
      import gravis as gv
      import networkx as nx

    data = [
    (‘A’, ‘B’, 2.2),
    (‘B’, ‘A’, 3.7),
    (‘B’, ‘C’, 0.9),
    ]

    dg = nx.DiGraph()
    for n1, n2, sent in data:
    dg.add_edge(n1, n2, size=sent)

    for node in dg.nodes:
    size = 0.0
    for n1, n2 in dg.in_edges(node):
    e = dg.edges[(n1, n2)]
    size += e[‘size’]
    dg.nodes[node][‘size’] = size * 5

    gv.d3(dg, edge_curvature=0.5)

    
    - **Интерактивность**: Gravis позволяет перемещать узлы и изменять их свойства, однако может потребоваться дополнительная реализация для фильтрации по диапазонам дат.
  2. Plotly

    • Описание: Plotly — это мощная библиотека для построения графиков, которая также поддерживает визуализацию графов.
    • Ограничения: Как было замечено, Plotly не поддерживает отображение направлений соединений так, как это требуется.
  3. D3.js через Python

    • Описание: Хотя D3.js не является библиотекой Python, можно использовать PyD3 или Flask-D3 для интеграции с Python. D3 позволяет создавать динамичные и интерактивные графики с высокой гибкостью.
    • Требования: Для работы с D3.js потребуется знание JavaScript и HTML для настройки интерфейса.
  4. Gephi

    • Состояние: Это мощная платформа для анализа и визуализации сетей, которая поддерживает разнообразные визуализации и может быть интегрирована с Python через сети GEXF. Однако это не библиотека в чистом виде и требует отдельного компонента.

Заключение

Для выполнения ваших требований по визуализации сетей с возможностью динамической интерпретации данных можно начать с библиотеки Gravis, так как она явно поддерживает большие части поставленных задач. Однако для полноценной реализации всех аспектов, включая динамическую фильтрацию, вам может понадобиться рассмотреть специализированные решения, такие как интеграция с D3.js.

С учетом этого, рекомендуем вам протестировать представленный код и оценить, насколько он соответствует вашим требованиям, прежде чем переходить к другим вариантам.

Оцените материал
Добавить комментарий

Капча загружается...