Как активировать окружение Python и выполнить команду Python в скрипте оболочки на виртуальной машине Ubuntu.

Вопрос или проблема

#!/bin/bash
export PATH=/home/zmumba/anaconda3/bin:$PATH

eval "$(/home/zmumba/anaconda3/bin/conda shell.bash hook 2> /dev/null)"
/home/zmumba/anaconda3/bin/conda run -n py12 python /home/zmumba/DA/Dekad_Progs/Programs/09_RiskMap.py

ModuleNotFoundError: No module named 'geopandas'

# All requested packages already installed.

source /home/zmumba/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh
conda activate py12

pip install numpy pandas shapely pyproj pyogrio pyproj packaging

pip install geopandas

git clone https://github.com/geopandas/geopandas.git
cd geopandas
pip install .

Ответ или решение

Для активации виртуального окружения Python и выполнения команды из оболочки на Ubuntu VM можно воспользоваться следующими подходами. Поскольку вы уже упомянули проблемы с запуском скрипта, когда он используете Anaconda, и возникает ошибка "ModuleNotFoundError: No module named ‘geopandas’", я предоставлю подробное руководство с шагами по устранению неполадок и выполнению вашего скрипта.

Шаг 1: Убедитесь в корректной установке Anaconda и зависимостей

1. Проверьте установку Anaconda:
   Убедитесь, что Anaconda установлена правильно, выполнив команду в терминале:

   conda --version

2. Проверьте наличие пакета geopandas:
   Активируйте ваше окружение и проверьте установленные пакеты:

   conda activate py12
   conda list geopandas

   Если пакет установлен, вывод должен содержать информацию о версии.

3. Если не установлен, установите geopandas:
   Используйте следующий команду, чтобы установить geopandas из канала conda-forge:

   conda install -c conda-forge geopandas

Шаг 2: Правильная настройка скрипта оболочки

Чтобы правильно запустить Python скрипт из bash скрипта, выполните следующие шаги:

1. Создайте создайте файл скрипта, например run_script.sh:

   #!/bin/bash
   # Задайте переменные окружения для Anaconda
   export PATH="/home/zmumba/anaconda3/bin:$PATH"
   source /home/zmumba/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh  # Инициализация сценариев conda
   
   # Активация вашего окружения
   conda activate py12
   
   # Выполнение вашего Python скрипта
   python /home/zmumba/DA/Dekad_Progs/Programs/09_RiskMap.py

2. Сделайте скрипт исполняемым:
   Убедитесь, что ваш скрипт имеет права на выполнение:

   chmod +x run_script.sh

Шаг 3: Выполнение скрипта

Теперь вы сможете выполнить ваш скрипт с помощью команды:

./run_script.sh

Шаг 4: Дополнительные проверки

Если вы все еще сталкиваетесь с ошибками после выполнения вышеуказанных шагов, вот несколько дополнительных шагов для устранения неполадок:

• Проверьте, что Anaconda правильно настроена:
  Иногда может помочь перезапуск терминала или системы после первого запуска Anaconda.

• Убедитесь в отсутствии конфликтующих версий пакетов: Использование pip и conda в одном окружении может привести к конфликтам. Убедитесь, что все необходимые пакеты установлены из одного источника, предпочтительно conda-forge.

• Установите зависимости вручную через pip, если Anaconda не помогает:
  Если вы предпочитаете pip, можете использовать команды, приведенные в вашем источнике:

  pip install geopandas

Заключение

С помощью вышеуказанных шагов вы сможете активировать виртуальное окружение Python и успешно выполнить ваш скрипт в Ubuntu VM. Пользуйтесь рекомендациями по управлению пакетами и окружениями, чтобы избежать проблем с несовместимыми версиями. Если проблема сохраняется, рассмотрите возможность создания нового виртуального окружения или даже новой виртуальной машины, чтобы исключить конфликты.