Вопрос или проблема
Я использую ggplot, чтобы сравнить 114 уникальных исследований по определенной переменной, которая меня интересует.
Вот что я использовал.
ggplot(steps, aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,)) + facet_wrap(~id_study,)
Хотя это работает, все 114 исследований изображены на одной странице, и форматирование все сжато. Как я могу разделить это на 4х4 страницы?
Большое спасибо
S
редактировать ****
Поскольку есть 114 уникальных исследований, у меня всего 5 страниц
1)
ggplot(steps, aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,))+ facet_wrap_paginate(~id_study, nrow = 5, ncol = 5, scales
= "fixed", shrink = TRUE, labeller = "label_value", as.table = TRUE, switch = NULL, drop = TRUE, dir = "h", strip.position = "top", page = 1)
2)
ggplot(steps, aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,))+ facet_wrap_paginate(~id_study, nrow = 5, ncol = 5, scales
= "fixed", shrink = TRUE, labeller = "label_value", as.table = TRUE, switch = NULL, drop = TRUE, dir = "h", strip.position = "top", page = 2)
3)
ggplot(steps, aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,))+ facet_wrap_paginate(~id_study, nrow = 5, ncol = 5, scales
= "fixed", shrink = TRUE, labeller = "label_value", as.table = TRUE, switch = NULL, drop = TRUE, dir = "h", strip.position = "top", page = 3)
4)
ggplot(steps, aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,))+ facet_wrap_paginate(~id_study, nrow = 5, ncol = 5, scales
= "fixed", shrink = TRUE, labeller = "label_value", as.table = TRUE, switch = NULL, drop = TRUE, dir = "h", strip.position = "top", page = 4)
5)
ggplot(steps, aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,))+ facet_wrap_paginate(~id_study, nrow = 5, ncol = 5, scales
= "fixed", shrink = TRUE, labeller = "label_value", as.table = TRUE, switch = NULL, drop = TRUE, dir = "h", strip.position = "top", page = 5)
все это на 1 странице?
спасибо
В зависимости от формы ваших графиков, имеет смысл создать четыре отдельных графика. Я предлагаю это просто потому, что имеет смысл показывать оси и метки на каждой отдельной странице, иначе читателю, возможно, придется постоянно возвращаться к, например, странице 1, чтобы увидеть, какие шкалы используются.
Я бы, вероятно, сделал что-то вроде 6 (строк) на 5 (столбцов) на каждой странице, предполагая портретную ориентацию страницы. Затем вам нужно просто отредактировать ваш код, чтобы сделать что-то вроде этого (как псевдокод):
page1 <- ggplot(steps[0:30]), aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,)) + facet_wrap(~id_study,)
page2 <- ggplot(steps[30:60]), aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,)) + facet_wrap(~id_study,)
page3 <- ggplot(steps[60:90]), aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,)) + facet_wrap(~id_study,)
page4 <- ggplot(steps[90:114]), aes(x=factor(edu))) + geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study,)) + facet_wrap(~id_study,)
Затем продолжайте экспортировать изображения по мере необходимости, например:
ggsave('./first_page_plots.pdf', page1, dpi=600)
ознакомьтесь с другими вариантами сохранения здесь.
Используйте ggforce. У него есть оболочки для разделения функции facet. Вы указываете, сколько графиков на странице, затем рассчитываете и вызываете функцию один раз для каждой страницы (вы можете сделать это программно, так как у нее также есть функция для определения количества необходимых страниц, затем сделать цикл).
.
Ответ или решение
Давайте рассмотрим вопрос о том, как с помощью пакета ggplot2 в R с использованием функции facet_wrap представить данные на нескольких страницах в формате PDF. Вы столкнулись с задачей сравнения 114 уникальных исследований на одной странице, что привело к переполнению графиков и проблемам с форматированием.
Теоретическая часть (Theory)
Возможно, вы уже знакомы с функцией facet_wrap из пакета ggplot2, которая позволяет разбивать данные на подгруппы и отображать их на отдельных панелях внутри одного графика. Однако, при большом количестве таких подгрупп, как в вашем случае с 114 исследованиями, целесообразно использовать технику разбиения графиков на несколько страниц, чтобы улучшить читаемость и сохранять аккуратный вид.
Пример (Example)
Для решения этой задачи используется пакет ggforce, который расширяет возможности ggplot2 и предоставляет метод facet_wrap_paginate. Он позволяет указать количество графиков на одной странице и автоматически распределяет их по страницам.
Пример использования facet_wrap_paginate выглядит следующим образом:
library(ggplot2)
library(ggforce)
# Простой пример использования facet_wrap_paginate для нескольких страниц
ggplot(data = steps, aes(x = factor(edu))) +
geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study)) +
facet_wrap_paginate(~id_study, nrow = 5, ncol = 5, page = 1) +
theme_bw()В этом примере графики распределяются на страницах с помощью параметра page. Можно программно разделить на разные страницы указав различные значения page.
Применение (Application)
Для того чтобы экспортировать все страницы в один PDF файл, можно воспользоваться дополнительной функцией в R для программного сохранения с помощью цикла. Это обеспечит более автоматизированное и эффективное разбиение ваших графиков, чего вы хотите добиться.
# Загрузка необходимых библиотек
library(ggplot2)
library(ggforce)
library(gridExtra)
# Функция, определяющая количество страниц
total_pages <- function(data, nrow, ncol) {
ceiling(nlevels(factor(data$id_study)) / (nrow * ncol))
}
nrow <- 5
ncol <- 5
pages <- total_pages(steps, nrow, ncol)
pdf("output_plots.pdf", onefile = TRUE)
for (i in 1:pages) {
p <- ggplot(steps, aes(x = factor(edu))) +
geom_bar(aes(y = (..count..), group = id_study)) +
facet_wrap_paginate(~id_study, nrow = nrow, ncol = ncol, page = i) +
theme_bw()
print(p)
}
dev.off()Здесь мы используем функцию total_pages для вычисления общего количества страниц и циклом сохраняем каждую страницу с помощью pdf(). Этот метод экономит время и ресурсы, особенно когда обработка ручного разбиения слишком трудоемка.
Таким образом, ggforce и метод facet_wrap_paginate решают проблему переполнения данных на одной странице, позволяя эффективно и аккуратно представить ваши 114 уникальных исследований. Все шаги обработки с ggplot в сочетании с ggforce и автоматической экспортной функцией помогут вам получить детализированный и аккуратно оформленный PDF, что позволит легче интерпретировать данные.