Вопрос или проблема
Пытаюсь установить pbh5-tools на свою виртуальную машину с Ubuntu 12.04. Столкнулся с бесчисленными проблемами при попытке установить программу. Возникает ошибка:
In file included from /tmp/easy_install-BEtAkS/h5py-2.5.0/h5py/defs.c:287:0:
/tmp/easy_install-BEtAkS/h5py-2.5.0/h5py/api_compat.h:27:18: fatal error: hdf5.h: No such file or directory
Пробовал скачать libhdf5-dev для решения этой проблемы, но когда использую sudo apt-get libhdf5-dev, получаю следующий ответ.
Package libhdf5-dev is a virtual package provided by:
libhdf5-serial-dev 1.8.4-patch1-3ubuntu2
libhdf5-openmpi-dev 1.8.4-patch1-3ubuntu2
libhdf5-mpich-dev 1.8.4-patch1-3ubuntu2
libhdf5-lam-dev 1.8.4-patch1-3ubuntu2
Когда пытаюсь установить отдельные пакеты, получаю тот же ответ:
E: Unable to locate package 1.8.4-patch1-3ubuntu2
Я скачал патч, сконфигурировал его, собрал и установил, но все равно не могу заставить его работать. Правда не знаю, что делать.
У меня была такая же проблема с Ubuntu 16.04 (не 18.04). Решил ее по совету Карол Юу на форуме Nvidia.
Попробуйте выполнить команду ниже и установить снова:
sudo add-apt-repository universe
sudo apt-get update
sudo apt-get install libhdf5-serial-dev
ОС: Ubuntu 16.04
Аппаратное обеспечение: Nvidia Jetson TX2
Ответ или решение
Для решения проблемы с установкой пакета libhdf5-dev на виртуальную машину Ubuntu 12.04, важно понимать контекст возникшей ситуации и последовательность необходимых шагов для устранения ошибки. Данная ошибка указывает на отсутствие заголовочного файла hdf5.h, который необходим для корректной установки зависимостей, связанных с pbh5-tools.
Анализ проблемы
Вы сталкиваетесь с проблемой установки libhdf5-dev, при выполнении команды sudo apt-get libhdf5-dev. Возникновение ошибки связано с тем, что libhdf5-dev является виртуальным пакетом, который предоставляется несколькими специфичными пакетами: libhdf5-serial-dev, libhdf5-openmpi-dev, libhdf5-mpich-dev, libhdf5-lam-dev. Причина, по которой система не может найти указанные версии, вероятнее всего, заключается в устаревших репозиториях или их недоступности для вашей версии Ubuntu.
Рекомендации по решению
-
Обновление репозиториев и добавление необходимых источников
- Выполните команду для добавления репозитория
universe, которая может содержать нужные пакеты:sudo add-apt-repository universe - Обновите список пакетов:
sudo apt-get update
- Выполните команду для добавления репозитория
-
Установка необходимого пакета
- Поскольку в вашем случае версия пакета указана как
1.8.4-patch1-3ubuntu2, установите наиболее близкий аналог из доступных:sudo apt-get install libhdf5-serial-dev
- Поскольку в вашем случае версия пакета указана как
-
Проверка зависимости
- Убедитесь в том, что пакет был успешно установлен, и заголовочный файл
hdf5.hдоступен. Это можно сделать, выполнив поиск файла:locate hdf5.h - При отсутствии файла попробуйте установить другие варианты пакета, такие как
libhdf5-openmpi-devилиlibhdf5-mpich-dev, учитывая зависимости вашего приложения и совместимость с вашей системой.
- Убедитесь в том, что пакет был успешно установлен, и заголовочный файл
Альтернативное решение (при необходимости)
Если вышеупомянутые методы не помогают, рассмотрите возможность ручной установки HDF5 из исходников. Это требует скачивания исходного кода с официального сайта HDF5, его компиляции и установки:
- Скачайте исходный код с сайта: HDF5 Downloads.
- Распакуйте архив и выполните следующие команды:
./configure make sudo make install
Заключение
Проблемы могут возникать из-за устаревшей версии ОС и необходимости самостоятельного управления зависимостями утилит. Убедитесь, что ваша система обновлена и все необходимые репозитории добавлены. Своевременное обновление операционной системы также может помочь избежать подобных сложностей в будущем.