Вопрос или проблема
Я работаю над моделью U-Net с двумя выходами: сегментация и классификация. Мой набор данных имеет 110 классов объектов в формате coco, и я использую TensorFlow/Keras для обучения модели. Сегментационная часть модели выдает классификации на уровне пикселей, а голова классификации предназначена для предсказания класса объекта. Однако, когда я пытаюсь обучить модель, я сталкиваюсь со следующей ошибкой:
import tensorflow as tf
from tensorflow.keras import layers, models
import numpy as np
import cv2
import json
import os
from pycocotools.coco import COCO
# Убедитесь, что пути к данным COCO верны
train_images_path = "/content/drive/MyDrive/fyp/FoodInsSeg/images/train"
train_annotations_path = "/content/drive/MyDrive/fyp/FoodInsSeg/annotations/Train.json"
# val_images_path = "/path/to/val/images"
# val_annotations_path = "/path/to/val/annotations.json"
import tensorflow as tf
import numpy as np
import cv2
from pycocotools.coco import COCO
from tensorflow.keras.utils import to_categorical
# Загрузка аннотаций набора данных COCO
train_coco = COCO(train_annotations_path)
class CustomDataset(tf.keras.utils.Sequence):
def __init__(self, image_paths, annotations, coco, num_categories=110, batch_size=1, shuffle=True):
self.image_paths = image_paths
self.annotations = annotations
self.coco = coco
self.num_categories = num_categories # Количество категорий для классификации
self.batch_size = batch_size
self.shuffle = shuffle
self.on_epoch_end()
def on_epoch_end(self):
self.indices = np.arange(len(self.image_paths))
if self.shuffle:
np.random.shuffle(self.indices)
def __len__(self):
return len(self.image_paths) // self.batch_size
def __getitem__(self, index):
batch_indices = self.indices[index * self.batch_size:(index + 1) * self.batch_size]
batch_image_paths = [self.image_paths[i] for i in batch_indices]
batch_annotations = [self.annotations[i] for i in batch_indices]
images = []
masks = []
labels = []
# Обработка каждого изображения и аннотации независимо
for img_path, ann_id in zip(batch_image_paths, batch_annotations):
# Загрузка изображения
img = tf.image.decode_jpeg(tf.io.read_file(img_path), channels=3)
img = tf.image.convert_image_dtype(img, tf.float32)
# Загрузка маски без изменения размера
ann = self.coco.loadAnns([ann_id])[0]
mask = self.coco.annToMask(ann)
category_id = ann['category_id']
# Расширение маски для добавления размерности канала
mask = np.expand_dims(mask, axis=-1)
mask = mask * category_id # Умножение на id категории (для многоклассовой классификации)
# One-hot кодирование меток классификации
one_hot_label = to_categorical(category_id, num_classes=self.num_categories)
# Добавление в списки батча
images.append(img)
masks.append(mask)
labels.append(one_hot_label)
# Возвращаем изображение и маску как один батч
return np.array(images), (np.array(masks), np.array(labels))
# Обернуть набор данных в tf.data.Dataset для совместимости с model.fit
def coco_dataset_loader(annotation_file, img_dir, batch_size):
dataset = CustomDataset(img_dir, annotation_file, train_coco, batch_size=batch_size)
return tf.data.Dataset.from_generator(
lambda: dataset,
output_signature=(
tf.TensorSpec(shape=(None, None, None, 3), dtype=tf.float32), # Динамические размеры изображений
(
tf.TensorSpec(shape=(None, None, None, 1), dtype=tf.int32), # Маски сегментации
tf.TensorSpec(shape=(None,), dtype=tf.int32) # Метки классификации
)
)
)
batch_size = 4
# Инициализация набора данных без изменения размера или дополнения
train_dataset = coco_dataset_loader(train_annotations_path, train_images_path, batch_size=batch_size) # val_dataset = CustomCocoDataset(val_annotations_path, val_images_path)
def unet_model(input_size, num_classes, num_categories):
inputs = layers.Input(input_size)
# Кодировщик (уменьшение размерности)
conv1 = layers.Conv2D(64, 3, activation='relu', padding='same')(inputs)
conv1 = layers.Conv2D(64, 3, activation='relu', padding='same')(conv1)
pool1 = layers.MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(conv1)
conv2 = layers.Conv2D(128, 3, activation='relu', padding='same')(pool1)
conv2 = layers.Conv2D(128, 3, activation='relu', padding='same')(conv2)
pool2 = layers.MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(conv2)
# Узкое место
conv3 = layers.Conv2D(256, 3, activation='relu', padding='same')(pool2)
# Декодер (увеличение размерности)
up2 = layers.Conv2DTranspose(128, 2, strides=(2, 2), padding='same')(conv3)
merge2 = layers.concatenate([conv2, up2])
conv4 = layers.Conv2D(128, 3, activation='relu', padding='same')(merge2)
up1 = layers.Conv2DTranspose(64, 2, strides=(2, 2), padding='same')(conv4)
merge1 = layers.concatenate([conv1, up1])
conv5 = layers.Conv2D(64, 3, activation='relu', padding='same')(merge1)
# Выходной слой для сегментации
seg_output = layers.Conv2D(num_classes, 1, activation='softmax', name="segmentation")(conv5)
# Голова классификации
flat = layers.GlobalAveragePooling2D()(conv3)
class_output = layers.Dense(num_categories, activation='softmax', name="classification")(flat)
model = models.Model(inputs, [seg_output, class_output])
return model
input_shape = (None, None, 3) # Позволить динамические размеры входа
# Создание модели
model = unet_model(input_size=input_shape, num_classes=2, num_categories=110)
# Компилирование модели
model.compile(optimizer="adam",
loss={'segmentation': 'sparse_categorical_crossentropy', 'classification': 'categorical_crossentropy'},
metrics={'segmentation': 'accuracy', 'classification': 'accuracy'})
# Обучение модели на первом наборе данных
model.fit(train_dataset, validation_data=train_dataset, epochs=10)
# Сохранение модели после обучения на первом наборе данных
model.save('/content/drive/MyDrive/fyp/unet/model_unet.h5')
# Загрузка модели и дообучение на втором наборе данных
# model = tf.keras.models.load_model('/path/to/save/model_unet.h5')
# train_dataset_2 = CustomCocoDataset('/path/to/second/dataset/annotations.json', '/path/to/second/dataset/images')
# val_dataset_2 = CustomCocoDataset('/path/to/second/val/annotations.json', '/path/to/second/val/images')
# model.fit(train_dataset_2, validation_data=val_dataset_2, epochs=10)
# # Сохранение финальной модели
# model.save('/path/to/save/final_model_unet.h5')
Ответ или решение
Вопрос о несоответствии формы входных данных и выходных данных в модели U-Net является распространенной проблемой, особенно когда речь идет о сложных архитектурах с несколькими выходами, таких как ваше решение, которое включает сегментацию и классификацию. Рассмотрим основные аспекты этой проблемы и возможные решения.
Проблема несоответствия формы
Несоответствие форм входных и выходных данных возникает, когда данные, передаваемые в модель, не соответствуют ожиданиям, заданным моделями или слоями, которые используются. В вашем случае ошибка может быть связана с несколькими причинами:
-
Динамические размеры входных данных: Ваша модель принимает входы с размерностью
(None, None, 3)
, что предполагает, что изображения могут иметь произвольные размеры. Это хорошо для гибкости, но может вызвать проблемы, если выходные данные, которые вы пытаетесь использовать для обучения, не соответствуют ожиданиям. -
Форма сегментационных масок: Сегментационные выходы создаются для каждого пикселя, и форма этих масок должна быть такой же, как и форма входного изображения (или допустимого размера в случае изменения). Убедитесь, что выходная форма модели соответствует размеру масок, производимых вашей моделью. Например, если ваше изображение имеет размерность
(height, width, 3)
, то маска должна иметь форму(height, width, 1)
. -
Кодирование и декодирование: Поток данных в методе
__getitem__
вашей последовательностиCustomDataset
должен быть внимательно проверен. Вам нужно удостовериться, что маска кодируется правильно, и что она соответствует первому выходному слоюsegmentation
в вашей модели.
Рекомендации
-
Изменение размера изображений и масок: Определите фиксированные размеры для всех входных изображений и масок перед передачей их в модель. Это может быть сделано с помощью
tf.image.resize()
или аналогичных методов. Например:img = tf.image.resize(img, (desired_height, desired_width)) mask = tf.image.resize(mask, (desired_height, desired_width))
-
Проверьте формы выходов модели: Убедитесь, что выходы в вашей модели имеют правильные формы, соответствующие по размеру с вашими масками. Например, выход слоя сегментации должен иметь форму
(None, None, num_classes)
для поиска классов пикселей. -
Проверьте, что ваши выходы соответствуют их меткам: Убедитесь, что выходные данные от модели для задачи классификации также соответствуют ожидаемым меткам. Для классификации, выход должен иметь форму
(batch_size, num_categories)
. -
Используйте отладочные выходные данные: Добавьте отладочный код для вывода форм каждого элемента данных перед тренировкой. Это упростит отладку, если возникнет несоответствие.
Заключение
Несоответствие форм входа и выхода является распространенной проблемой в моделях глубокого обучения, особенно в таких комплексных задачах, как ваша, связанная с сегментацией и классификацией объектов. Следуя описанным рекомендациям и проверяя формы ваших данных, вы сможете устранить ошибку и успешно обучить модель U-Net. Удачи в ваших исследованиях и разработках!