Безопасно ли использовать apt внутри среды conda?

Вопрос или проблема

У меня есть скрипт на Python, который управляет обновлением системы, вызывая apt с различными аргументами через модуль subprocess.

Он зависит от библиотек python_toolkit и docker, поэтому их нужно установить.

До сих пор я устанавливал эти два модуля в пользовательскую среду Python, то есть в интерпретатор Python с библиотеками, которые находятся где-то в ~/.

Python 3.12 теперь настоятельно рекомендует не использовать Python без виртуальной среды, если нужно использовать внешние библиотеки, что можно обойти, добавив --break-system-packages.

По этой причине я установил python_toolkit и docker в среду miniconda и теперь выполнил мой скрипт один раз. Кажется, что это сработало, но я не уверен, безопасно ли это, вызывать apt из среды Conda, в основном из-за возможного изменения LD_LIBRARY_PATH.

Стоит ли мне лучше создать обычную виртуальную среду или использование --break-system-packages может быть таким же хорошим? В моем случае, ничего другого, кроме этих двух библиотек, никогда не понадобится для использования Python без среды. Все остальное выполняется в средах Conda.

Ответ или решение

Вопрос о безопасности вызова apt изнутри среды Conda поднимает несколько важных аспектов, которые следует рассмотреть. Прежде чем углубиться в технические детали, стоит отметить одну ключевую теоретическую основу: среды, такие как Conda, разработаны для управления зависимостями и изоляции окружений, в то время как пакетные менеджеры, такие как apt, ориентированы на управление системными пакетами. Эти инструменты функционируют на разных уровнях и имеют разные задачи, что делает их совместное использование потенциально рискованным, если не соблюдаются определенные меры предосторожности.

Теория

На высоком уровне, apt управляет пакетами, которые установлены на уровне всей системы. Он обновляет, устанавливает и удаляет пакеты, которые могут воздействовать на основные компоненты операционной системы. С другой стороны, Conda управляет изолированными средами, которые часто содержат собственные версии библиотек и интерпретаторов, независимые от основной системы.

Одним из факторов, вызывающих обеспокоенность, является переменная окружения LD_LIBRARY_PATH, которая может изменить способ нахождения динамических библиотек в процессе выполнения. Conda может настраивать эту и подобные ей переменные для обеспечения изоляции окружения, что может в теории вызвать непредвиденное поведение системных утилит, таких как apt.

Пример

Рассмотрим пример использования Conda и apt в контексте Python-скрипта, который управляет обновлениями системы. Вы уже упомянули, что используете python_toolkit и docker, которые установлены в среде Conda. При запуске скрипта в этой среде subprocess будет наследовать ряд переменных окружения от Conda, включая пути к библиотекам.

Если Conda настраивает LD_LIBRARY_PATH для использования своих собственных библиотек, это может создать ситуацию, когда apt начнет использовать несовместимые или неожиданные версии библиотек. Это может привести к сбоям в работе apt, особенно если системные утилиты зависят от определённых версий библиотек.

Применение

Исходя из теории и примера, безопаснее и разумнее избегать вызовов apt изнутри среды Conda. Лучше следующим образом организовать ваш процесс:

Создание обособленных окружений: Используйте Conda для управления Python-зависимостями без включения системных инструментов в этот процесс. Это позволит минимизировать влияние Conda на apt и другие системные утилиты.
Использование системного Python с отдельными окружениями: Рассмотрите возможность создания виртуальной среды с использованием системного Python для установки и использования python_toolkit и docker. Это позволит избежать изменения системных библиотек, которые могут быть затронуты apt.
Отказ от использования --break-system-packages: Аргумент --break-system-packages разрешает использование внешних библиотек без виртуальной среды, но его применение может привести к нежелательным конфликтам и нарушениям целостности пакетов системы.
Скрипты управления средствами обновления: Проверьте, чтобы ваш скрипт управлением апдейтов принимал во внимание окружение, в котором он выполняется, и избегайте переноса переменных сред от Conda к системным операциям, таким как вызовы apt.

Таким образом, подход, заключающийся в разделении задач и инфраструктуры управления окружением, позволит сохранить стабильность системы и избежать проблем при взаимодействии утилит разных уровней. Предоставление вашему скрипту гибкости в выборе подходящего окружения для определённых задач – залог успешного и безопасного использования как Conda, так и системных инструментов управления пакетами.