Pymol не запускается после загрузки с использованием командной строки Linux

На чтение 3 мин Опубликовано 26.09.2024

Вопрос или проблема

Всем привет, я в данный момент использую Ubuntu 24.04.1 LTS

Я скачиваю из терминала Linux, используя команду “sudo apt-get install pymol” и успешно устанавливаю pymol.

> sudo apt-get install pymol
Чтение списков пакетов... Готово
Формирование дерева зависимостей... Готово
Чтение информации о состоянии... Готово
pymol уже является самой новой версией (2.5.0+dfsg-1build6).
0 обновлено, 0 новых установлено, 0 удалено и 2 не обновлено.

Однако, когда я пытаюсь запустить программу, используя команду терминала pymol, появляется следующая ошибка.

$ pymol
След трассировки (последний вызов последним):   
Файл "<frozen runpy>", строка 189,> в _run_module_as_main   
Файл "<frozen runpy>", строка 112, в> _get_module_details  
Файл "/usr/lib/python3/dist-packages/pymol/__init__.py", строка 81, в> <module>>    
 from imp import find_module ModuleNotFoundError: Нет модуля с именем 'imp'

Привет, я сталкиваюсь с той же проблемой, и я тоже использую Ubuntu 24.04.1 LTS.

Ответ или решение

Для решения проблемы с запуском PyMOL на Ubuntu 24.04.1 LTS, которая связана с ошибкой ModuleNotFoundError: No module named 'imp', вам следует выполнить несколько шагов. Эта ошибка возникает из-за того, что модуль imp устарел в Python 3 и был удален в более поздних версиях. PyMOL может не поддерживать последние версии Python, поэтому нужно предпринять следующие шаги:

Проверьте версию Python: Убедитесь, что у вас установлена совместимая версия Python. PyMOL полагается на Python 2.7, так что убедитесь, что оно установлено, и эта версия Python доступна.
```
python --version
```
Если версия Python у вас 3.x, выполняйте следующий шаг.
Установите Python 2.7:
```
sudo apt-get install python2
```
Установите PyMOL с поддержкой Python 2: Если PyMOL был установлен для Python 3 и вы хотите использовать Python 2, может потребоваться переустановка с правильными зависимостями.

Вы можете попробовать удалить текущую версию PyMOL и установить ее заново:
```
sudo apt-get remove pymol
sudo apt-get install pymol
```
Это должно установить версию, совместимую с Python 2.
Запустите PyMOL с конкретной версией Python:

Если PyMOL все еще не запускается, попробуйте явно указать версию Python:
```
python2 /usr/bin/pymol
```
Обновите систему и зависимости: Иногда проблема может быть связана с устаревшими библиотеками или программным обеспечением. Убедитесь, что ваша система полностью обновлена:
```
sudo apt-get update
sudo apt-get upgrade
```
Проверка наличия обновлений для PyMOL: Иногда разработчики выпускают обновления для исправления подобных ошибок. Проверьте, нет ли более новой версии PyMOL, или рассмотрите возможность установки PyMOL через другие менеджеры пакетов, такие как Conda, который может помочь совместить зависимости.
```
sudo apt install conda
conda install -c schrodinger pymol
```

После выполнения всех шагов попробуйте снова запустить PyMOL:

pymol

Если возникают дополнительные проблемы или ошибки, предоставьте текст ошибок, и мы постараемся помочь вам дальше.