Совмещение точечного графика с виолиновым графиком

Вопрос или проблема

.

Ответ или решение

Для создания визуализации, состоящей из виолинчатой диаграммы с наложенными точечными графиками и средними значениями, необходимо обратить особое внимание на правильное выравнивание данных. Ошибки в согласовании графиков могут возникнуть в результате некорректного распределения данных или параметров визуализации.

Контекст задачи

Ваша цель состоит в том, чтобы отобразить относительное процентное покрытие растительности по пяти различным обработкам на двух площадках. Вы используете пакет ggplot2 в языке R для создания диаграммы.

Анализ текущего подхода

Ваша функция ggplot создает виолинчатую диаграмму с наложенными точечными графиками, однако данные точек и средние значения могут не совпадать с виолинчатым распределением. Ключевыми моментами для исправления данной проблемы являются:

1. Проверьте соответствие осей: Убедитесь, что данные, используемые в aes(Site, SppCov), соответствуют фактическим осям виолинчатой диаграммы. Правильное назначение значений осей критически важно.

2. Код для построения:

   library(ggplot2)
   
   ggplot(litter, aes(x = Site, y = SppCov, fill = factor(trtlit))) +
    geom_violin(trim = FALSE) +
    geom_dotplot(binaxis = "y", stackdir = "center", position = position_jitter(width = 0.1), dotsize = 0.4) +
    stat_summary(fun.data = "mean_se", geom = "pointrange", color = "black", size = 0.75, position = position_dodge(width = 0.75)) +
    stat_summary(geom = "errorbar", width = 0.1, position = position_dodge(width = 0.75)) +
    theme(axis.ticks = element_line(colour = "black", size = 2),
          axis.ticks.length = unit(0.2, 'cm'),
          axis.text = element_text(size = 18),
          legend.position = "none") +
    scale_fill_manual(values = c('white', 'grey', 'steelblue', 'chartreuse3', 'darkorange'))

Рекомендации по согласованию

• Используйте position_jitter(): Примените position_jitter() в параметре position для geom_dotplot(), чтобы избежать наложения точек друг на друга. Это также поможет более наглядно представить обширность данных в одном участке на одной диаграмме.

• Проверьте данные на пропуски и аномалии: Убедитесь, что в ваших данных нет пустых значений или аномальных данных, которые могут нарушить корректное отображение.

• Сравните категории: Проверьте, чтобы уровни фактора trtlit синхронизировались с данными в ваших осевых переменных. Иногда неверное назначение уровней может привести к несоответствию между данными и визуализацией.

• Согласование вычислений: Убедитесь, что расчеты для stat_summary и точечного графика выполняются по одним и тем же группам данных.

Заключение

Синхронизация виолинчатой диаграммы с точечными графиками и средними значениями требует внимательности к деталям, особенно при работе с факторами и параметрами визуализации. Внимательно следуя приведенным рекомендациям, вы сможете создать информативную и визуально привлекательную диаграмму, которая отобразит данные так, как вы этого хотите.