snakemake

Вопрос или проблема Мой рабочий процесс ветвится следующим образом: A -> temp(B) -> C … A -> temp(B) -> D Таким образом, когда я хочу произвести D после C, это регенерирует B, но, делая это, мой рабочий процесс затем считает, что C нужно

Вопрос или проблема Я пытаюсь выполнить snakemake 8 на узле GKE с GPU, однако параметры ресурсов в документации, похоже, не запускают никаких автонастроек через Kubernetes. Согласно документации, есть несколько мест, где вы можете указать флаг ресурсов

Вопрос или проблема У меня есть snakemake, который задерживается после начала выполнения. У меня есть правила, которые выполняются на кластере (через pbs) и запускают внешний скрипт на Python. Я заметил, что сейчас некоторые из правил задерживаются на