установка VisIt

Я совершенно новичок в системах Linux. Я начал использовать Ubuntu пару недель назад. Причина в том, что я провожу некоторые симуляции методом конечных элементов в FeniCS для своей диссертации. Однако до сих пор я смог установить несколько программ, таких как ParaView и другие, и начал писать некоторые программы на FeniCS. В настоящее время я застрял, пытаясь установить VisIt, который мне действительно очень нужен для просмотра и визуализации огромного вывода, который я получил из FeniCS.

Я скачал VisIt 2.12.3 отсюда
https://wci.llnl.gov/simulation/computer-codes/visit/executables

Затем я пытался следовать многим инструкциям по его установке, которые нашел в интернете, таким как

https://github.com/mit-crpg/OpenMOC-LOO/wiki/Install-on-Ubuntu

На этой странице вам предлагают выполнить эти 6 команд:

$ sudo apt-get install m4  
$ sudo apt-get install mesa-utils  
$ sudo apt-get install libgl1-mesa-swx11  
$ sudo apt-get install tcl-vtk  
$ sudo apt-get install libxmu-dev  
$ sudo apt-get install gtk2-engines-pixbuf 

Они выполняются нормально

после этого ничего не работает, хотя я изменил имена файлов, чтобы они соответствовали тем, которые я скачал.

В любом случае, я знаю, что звучит глупо и наивно, но можете дать мне детальные шаги по установке? Я пытаюсь разобраться с Ubuntu, чтобы закончить свое исследование и наконец получить этот диплом.

П.С. Когда я скачиваю VisIt, скачиваются два файла. Один — это файл исходного кода, а другой — сценарий или что-то подобное.

============================================================

Инструкции и ошибки, которые я получил, когда следовал им:

Сначала из ссылки

 $ mkdir VisIt

Я создал и перешел в этот каталог

2 файла были загружены с веб-страницы VisIt в этот каталог

visit2.12.3.tar.gz.part

visit2.12.3.tar.gz

Я выполнил эту команду

  $ chmod 755 visit-install2_4_1.sh

Я получил ошибку “Нет такого файла или директории”

Я проверил имя файла, поэтому изменил команду на

  $ chmod 755 visit2.12.3.tar.gz

выполняется нормально

затем

   $ sudo ./visit-install2_4_1 2.4.1 linux-x86_64-ubuntu8 /usr/local/visit

ошибка “команда не найдена”

Я попытался снова сопоставить имя файла

   $ sudo ./visit2.12.3.tar.gz.part 2.13.3 linux-x86_64-ubuntu16 /usr/local/visit

Я все еще получал ту же ошибку. Я изменил платформу с ubuntu8 на ubuntu16, потому что у меня Ubuntu 16.04

Настройка VisIt 2.1.3 Ubuntu 18.10 без прав администратора

Я просто скачал его и успешно запустил бинарные файлы напрямую:

• перейдите на сайт загрузки: https://wci.llnl.gov/simulation/computer-codes/visit/executables

• скачайте версию “Linux – x86_64 64 bit”

• распакуйте:

  tar xvf visit2_13_3.linux-x86_64-ubuntu18.tar.gz`
  

• запустите:

  ./visit2_13_3.linux-x86_64/bin/visit
  

Например, я использовал его на: https://stats.stackexchange.com/questions/376361/how-to-find-the-sample-points-that-have-statistically-meaningful-large-outlier-r

Я только что установил visit 2.12.3 в Ubuntu 16.04. Вот как я это сделал. Думаю, следуя этим инструкциям, вы сможете выполнить установку, если найдете кого-то из центра компьютерной помощи в вашем университете, чтобы шаг за шагом помочь вам.

Скачайте исполняемый файл:
Linux – x86_64 64 bit
Ubuntu 14.04, 3.13.0-91-generic #138-Ubuntu SMP, gcc 4.8

Загрузка появится в вашей папке Загрузки как:

visit2_12_3.linux-x86_64-ubuntu14.tar.gz

Вам также нужен оболочный скрипт, который осуществляет установку. Скопируйте весь текст с следующего сайта в пустой документ и сохраните его под названием

visitInstallScript20171102.sh

http://portal.nersc.gov/project/visit/releases/2.12.3/visit-install2_12_3

Файлы .tar.gz и .sh должны находиться в одной папке, поэтому поместите их в одну папку.

Откройте терминал и перейдите в эту папку.

Затем установите разрешения, чтобы вы могли запустить оболочный скрипт для установки.

chmod 755 visitInstallScript20171102.sh

Я предпочитаю размещать что-то вроде visit в /usr/local/bin. Так что теперь запустите оболочный скрипт для установки visit:

 sudo ./visitInstallScript20171102.sh 2.12.3 linux-x86_64-ubuntu14 /usr/local/bin/visit

Четвертый элемент в этой строке должен соответствовать определенной части имени файла .tar.gz, поэтому не изменяйте его.

Система запросит ваш пароль, потому что вы запустили команду с помощью sudo. Введите свой пароль. Вы должны быть sudo, чтобы поместить что-то в /usr/local/bin.

Теперь установка должна произойти через оболочный скрипт, который вы только что запустили.

Верните разрешения на оболочный скрипт обратно в неисполняемые, просто чтобы убрать за собой:

chmod 664 visitInstallScript20171102.sh

Добавьте visit в ваш PATH, чтобы вы могли легко запускать visit, открыв терминал и введя visit. Используйте текстовый редактор, чтобы отредактировать файл /home/username/.bashrc. Добавьте строку:

export PATH="/usr/local/bin/visit/bin:$PATH"

Запустите visit, закрыв все терминалы и начиная в новом терминале: введите visit и нажмите Enter. Возможно, перезагрузите компьютер, если он все еще не запускается.

Все, что я сделал до сих пор с visit, это запустить его и убедиться, что он хотя бы запускается; он действительно запускается. Проект deal.ii имеет серию видео, и некоторые из видео показывают, как использовать visit. Вот куда я направляюсь.

Примечание: visit не работает должным образом в менеджере окон i3; он зависает при запуске. visit работает в стандартной версии Ubuntu 16.04. Я действительно хочу, чтобы он работал в i3.